141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0094 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  100 
 
 		 73 aa  136  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  62.26 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  53.12 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1227  30S ribosomal protein S21  59.65 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000014804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  48.21 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  47.92 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  45.16 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  52 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  45.16 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  50 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  45.16 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  47.92 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  52 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0416  ribosomal protein S21  52.83 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  49.06 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  51.11 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  54.72 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  52.83 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  48.94 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  48.08 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  53.33 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  46.67 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  43.48 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>