28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0023 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  100 
 
 
2233 aa  4346    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  28.71 
 
 
1402 aa  145  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  32.15 
 
 
1171 aa  133  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
1709 aa  132  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  28.54 
 
 
1700 aa  131  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  28.83 
 
 
1260 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  28.83 
 
 
1260 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  28.61 
 
 
1171 aa  117  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  30.42 
 
 
1175 aa  103  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  36.43 
 
 
1143 aa  101  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  30.19 
 
 
1175 aa  100  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  22.88 
 
 
1222 aa  100  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  31.33 
 
 
1140 aa  95.5  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.14 
 
 
2000 aa  94.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  29.47 
 
 
2118 aa  92  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29.79 
 
 
1984 aa  90.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  23.56 
 
 
1757 aa  75.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  27.74 
 
 
2886 aa  67.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  28.57 
 
 
1580 aa  67.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  26.43 
 
 
1702 aa  64.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  28.06 
 
 
2853 aa  61.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  24.7 
 
 
2434 aa  59.7  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  24.88 
 
 
1809 aa  58.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  26.23 
 
 
2418 aa  57.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.39 
 
 
1898 aa  50.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.02 
 
 
924 aa  48.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  27.39 
 
 
1441 aa  48.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  25.82 
 
 
1278 aa  46.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>