More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1390 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  100 
 
 		 266 aa  533  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  55.34 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  54.51 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  53.53 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  53.01 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  51.88 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  51.88 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  50.37 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  51.3 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  49.63 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  51.11 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  51.11 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  53.53 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  48.79 
 
 		 269 aa  255  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  51.13 
 
 		 251 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  51.13 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  51.28 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  51.38 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  49.44 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  48.89 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  45.91 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  50.75 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  50 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  49.63 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  50 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  47.41 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  49.63 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  46.81 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  46.45 
 
 		 305 aa  241  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  46.52 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  46.93 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  46.52 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  46.81 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  46.84 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  50 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  47.04 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  49.82 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  49.82 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  46.1 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  47.64 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  44.84 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  45.07 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  46.95 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  44.84 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  48.74 
 
 		 304 aa  230  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  41.5 
 
 		 297 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  42.36 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  45.36 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  41.93 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  44.22 
 
 		 297 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  44.03 
 
 		 305 aa  228  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  46.72 
 
 		 301 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  42.14 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  43.89 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  43.79 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  41.41 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  43.89 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  41.54 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  43.89 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  41.41 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  43.89 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  42.72 
 
 		 325 aa  225  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  42.33 
 
 		 324 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  42.33 
 
 		 324 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  45.15 
 
 		 268 aa  224  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  42.33 
 
 		 324 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  42.33 
 
 		 324 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  41.9 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  42.33 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  41.74 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  42.57 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  42.57 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  45.65 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  45.65 
 
 		 299 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  40.5 
 
 		 321 aa  221  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  45.93 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  41.33 
 
 		 321 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  47.31 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  42.71 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  47.57 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  45.86 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  45.86 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  40.7 
 
 		 325 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  45.36 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  43.22 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  39.46 
 
 		 332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  40.28 
 
 		 321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  39.16 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  39.46 
 
 		 332 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>