More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0724 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  46.15 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  47.95 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  45.65 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  44.16 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  46.1 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  46.21 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  47.92 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  47.59 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  44.2 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  42.04 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  47.22 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  44.2 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  47.22 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  44.2 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  47.22 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.22 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  46.53 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.53 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  44.93 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  44.93 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  44.68 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  46.1 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  46.53 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  46.1 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  46.53 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  43.88 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.48 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  43.48 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  46.53 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  43.48 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  42.42 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  43.48 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  47.52 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  37.24 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  35.14 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  33.13 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  33.13 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  35.81 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.97 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.41 
 
 		 218 aa  84.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.9 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.39 
 
 		 518 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40 
 
 		 162 aa  84.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.58 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  30.88 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  37.17 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  43.09 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  29.25 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.06 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.25 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  36.11 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  34.23 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.57 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.47 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  38.14 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  32.62 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.86 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  33.1 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.29 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.04 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  34.75 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.44 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  33.79 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  37.07 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.69 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.78 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  29.7 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.46 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  32.86 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.69 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.45 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.2 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.62 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.88 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.04 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  43.01 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  43.01 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  31.51 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.59 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.68 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  31.72 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  31.29 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  32.65 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  32.12 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  32.41 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>