More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0509 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.44 
 
 		 134 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  64.71 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  68.46 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.56 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  59.56 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.56 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.83 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.07 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  61.83 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 138 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  61.07 
 
 		 136 aa  166  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 159 aa  166  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.82 
 
 		 139 aa  165  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 139 aa  165  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 140 aa  165  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  61.07 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  60.45 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.54 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  55.8 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  59.23 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  55.8 
 
 		 138 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.23 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  58.54 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.39 
 
 		 405 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  54.89 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 140 aa  143  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 313 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 313 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.6 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  53.6 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  52 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.91 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  56 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  53.51 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4011  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00055516  normal  0.87616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  49.62 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2605  DnaK suppressor protein  49.6 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.59 
 
 		 223 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.59 
 
 		 223 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  50.4 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  51.22 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  49.6 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  49.6 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 229 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  52.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000789924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3338  RNA polymerase-binding transcription factor  48.8 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000258197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3468  RNA polymerase-binding transcription factor  48.8 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  52.17 
 
 		 228 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  48.8 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0685  RNA polymerase-binding transcription factor  48.8 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0013378  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  53.85 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3114  RNA polymerase-binding transcription factor  49.6 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0231493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1005  RNA polymerase-binding transcription factor  48.8 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.88 
 
 		 207 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03446  hypothetical protein  48 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002565  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  48 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  50.43 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  51.28 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0227  DnaK suppressor protein DksA  52.99 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.143062  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  48 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000337551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  48 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  48 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  48 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  48 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>