57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3292 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3292  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  555  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.876722  normal  0.149263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  50 
 
 
563 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.98 
 
 
525 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  43.68 
 
 
558 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  34.67 
 
 
548 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.26 
 
 
555 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.24 
 
 
528 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  32.94 
 
 
554 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  35.33 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  34.42 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  42.05 
 
 
559 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  45.83 
 
 
557 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  40.91 
 
 
558 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  27 
 
 
559 aa  55.8  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  28.66 
 
 
562 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  28.29 
 
 
555 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.87 
 
 
525 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  35.23 
 
 
539 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  34.12 
 
 
553 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  38.83 
 
 
552 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  35.87 
 
 
553 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  31.62 
 
 
543 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.39 
 
 
546 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.62 
 
 
519 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  42.86 
 
 
551 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  34.18 
 
 
541 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  35.23 
 
 
542 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  40.74 
 
 
553 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  34.04 
 
 
552 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  42.86 
 
 
552 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  33.71 
 
 
554 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.91 
 
 
532 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  31.63 
 
 
545 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  31.48 
 
 
543 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.47 
 
 
551 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.28 
 
 
537 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  28.8 
 
 
500 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  25.5 
 
 
553 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  33.71 
 
 
560 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  35.44 
 
 
551 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  29.91 
 
 
545 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  30.61 
 
 
543 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  26.88 
 
 
560 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  32.58 
 
 
558 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  30.83 
 
 
542 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  30.83 
 
 
542 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  31.82 
 
 
558 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  33.71 
 
 
543 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  27.39 
 
 
553 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  27.39 
 
 
553 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  26.24 
 
 
557 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.03 
 
 
530 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  33.82 
 
 
547 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  25.64 
 
 
542 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  35.38 
 
 
535 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  27.63 
 
 
570 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.33 
 
 
529 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>