161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1830 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 85 aa  173  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  65.43 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  65.43 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  68.29 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  62.96 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  45.57 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  45.68 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  48.75 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  40.96 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  43.04 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.55 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  45.68 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  37.35 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  36.14 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  36.14 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  36.14 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  34.18 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  39.51 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  40.79 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  44.78 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  38.1 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  38.1 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  47.17 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  36.59 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  34.57 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  45.1 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  37.93 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  46.77 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  36.11 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  36.11 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  36.11 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  45.28 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  37.21 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  40.32 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  40.32 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  44.78 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  45.28 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  34.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44.78 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  36.26 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  37.31 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  37.7 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  43.64 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  36.07 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  32.94 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  42.59 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  32.58 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>