99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1801 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  42.51 
 
 
252 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  43.14 
 
 
299 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  41.96 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  41.02 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  40.86 
 
 
309 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 
255 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 
255 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
255 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  40.38 
 
 
299 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  41.02 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  43.87 
 
 
257 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.61 
 
 
304 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  37.25 
 
 
258 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  39.06 
 
 
259 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  36.05 
 
 
258 aa  148  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  34.13 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
255 aa  118  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  30.77 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  34.67 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  28.63 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.35 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.15 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  32.16 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  31.16 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  30.5 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  30.26 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  33.16 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  28.76 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  29.76 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  27.91 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  27.84 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  24.17 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  23.91 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.3 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  22.95 
 
 
324 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  22.83 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.9 
 
 
367 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  22.83 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  22.83 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  22.83 
 
 
423 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  22.4 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  33.18 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  27.51 
 
 
261 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  22.95 
 
 
324 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.97 
 
 
590 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  26.09 
 
 
335 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  27.11 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
353 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  22.99 
 
 
375 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  25.13 
 
 
414 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
352 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  22.95 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  27.37 
 
 
363 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  22.99 
 
 
324 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.12 
 
 
362 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  31.87 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  31.87 
 
 
353 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.29 
 
 
368 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.27 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  26.98 
 
 
296 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  26.42 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  27.57 
 
 
350 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  27 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  26.09 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  29.59 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
353 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  24.04 
 
 
369 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  27.21 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  25.42 
 
 
363 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  25.53 
 
 
358 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  24.05 
 
 
320 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  24.05 
 
 
320 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.47 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  21.76 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  25.77 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  25.77 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  21.61 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0567  hypothetical protein  36.19 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0190057  hitchhiker  0.00000419669 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  25.93 
 
 
362 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  27.13 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  24.48 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  27.81 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  23.24 
 
 
354 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.63 
 
 
335 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  23.08 
 
 
377 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  27.87 
 
 
303 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  19.59 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  21.43 
 
 
320 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  21.33 
 
 
320 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
225 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  26.74 
 
 
336 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  24.46 
 
 
335 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  22.78 
 
 
320 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  22.15 
 
 
320 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>