More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1612 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  246  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  72.44 
 
 		 127 aa  184  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  71.65 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  67.19 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  65.87 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  59.35 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 128 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  59.32 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  55.04 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  47.24 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  57.39 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  49.19 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  49.12 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>