39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0042 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  652    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  52.19 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  52.96 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  49.41 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  47.63 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  49.7 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  31.68 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  31.28 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  34.12 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  33.7 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.85 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.64 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  27.59 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  31.68 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  37.37 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  29.24 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  35.29 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  31.87 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  26.96 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0405  FHA domain containing protein  26.59 
 
 		 490 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  28.79 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  28.64 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  31 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  32.89 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  26.37 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  29.18 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 		 444 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  31.55 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  31.17 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.75 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  30 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.98 
 
 		 442 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  25.9 
 
 		 445 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.81 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  32.2 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>