More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1680 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.15 
 
 
152 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  74.22 
 
 
162 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.86 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  59.15 
 
 
178 aa  166  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.15 
 
 
167 aa  166  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.86 
 
 
170 aa  166  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  59.15 
 
 
167 aa  166  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  59.15 
 
 
178 aa  166  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  59.15 
 
 
178 aa  166  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  59.15 
 
 
178 aa  166  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  59.15 
 
 
178 aa  166  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  61.11 
 
 
155 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  58.45 
 
 
167 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.86 
 
 
168 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  59.86 
 
 
200 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  59.86 
 
 
187 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  59.86 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  58.45 
 
 
167 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  58.45 
 
 
165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  58.33 
 
 
165 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.33 
 
 
165 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  57.04 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  57.75 
 
 
172 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  57.75 
 
 
172 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  57.04 
 
 
172 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  57.04 
 
 
172 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  58.45 
 
 
163 aa  158  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  56.34 
 
 
148 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  56.34 
 
 
148 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
176 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  57.04 
 
 
172 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.44 
 
 
175 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
137 aa  157  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.33 
 
 
174 aa  157  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  57.75 
 
 
168 aa  156  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.23 
 
 
223 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  53.62 
 
 
182 aa  155  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
162 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
164 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.86 
 
 
155 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  55.94 
 
 
151 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.81 
 
 
475 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.04 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  62.4 
 
 
164 aa  153  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 
158 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  57.04 
 
 
168 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
174 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  56.34 
 
 
146 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.23 
 
 
166 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  57.64 
 
 
170 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.63 
 
 
162 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
190 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.45 
 
 
197 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
175 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.82 
 
 
189 aa  150  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.81 
 
 
190 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  54.93 
 
 
165 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
175 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.45 
 
 
363 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
182 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  54.23 
 
 
222 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.04 
 
 
150 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 
177 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  51.8 
 
 
177 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  57.94 
 
 
194 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  51.05 
 
 
195 aa  147  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  53.62 
 
 
189 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.25 
 
 
252 aa  146  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  57.04 
 
 
205 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.43 
 
 
484 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  52.82 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  56.25 
 
 
222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.63 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.7 
 
 
169 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  57.94 
 
 
182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  53.85 
 
 
158 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  56.64 
 
 
176 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  58.06 
 
 
196 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  57.14 
 
 
182 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.6 
 
 
361 aa  143  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.6 
 
 
361 aa  143  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  52.11 
 
 
183 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  52.82 
 
 
193 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.15 
 
 
181 aa  142  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  55.24 
 
 
177 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.41 
 
 
177 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.03 
 
 
461 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  52.11 
 
 
152 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.26 
 
 
159 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.24 
 
 
177 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.38 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.45 
 
 
187 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.38 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>