More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1633 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.94 
 
 
233 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.8 
 
 
236 aa  291  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.94 
 
 
233 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.94 
 
 
233 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.94 
 
 
233 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  59.91 
 
 
233 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.51 
 
 
233 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.53 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  58.8 
 
 
251 aa  264  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  59.83 
 
 
233 aa  246  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  58.37 
 
 
244 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.89 
 
 
243 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.63 
 
 
227 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.78 
 
 
229 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.22 
 
 
222 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.22 
 
 
222 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.66 
 
 
222 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.83 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.45 
 
 
233 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.82 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.16 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.22 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.11 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.28 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.28 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.28 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.33 
 
 
231 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.07 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.89 
 
 
229 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.95 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.99 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.36 
 
 
253 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.63 
 
 
228 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.38 
 
 
232 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.36 
 
 
237 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.95 
 
 
233 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.64 
 
 
237 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.47 
 
 
237 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.95 
 
 
233 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  29.07 
 
 
258 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  29.39 
 
 
228 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.92 
 
 
237 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  29.13 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.74 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.19 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.33 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.67 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  32.09 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  42.53 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.96 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.96 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.34 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.99 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  50 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.12 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  37.5 
 
 
344 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42.53 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.37 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  38.78 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3222  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.31 
 
 
404 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.57 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0513  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.31 
 
 
404 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145575  normal  0.33275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0740  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.31 
 
 
404 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.57 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.79 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
250 aa  55.1  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.65 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.28 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  43.37 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  35.06 
 
 
1085 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  40 
 
 
444 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  38.55 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.78 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.83 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.37 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.46 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.09 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0727  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.74 
 
 
406 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.560156  normal  0.551186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5901  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.74 
 
 
406 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.544208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.23 
 
 
236 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>