More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0638 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  40.56 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  38.04 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  36.08 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  39.38 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  40.61 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  34.55 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  34.55 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  34.55 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  36.06 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  36.06 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  36.06 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  34.52 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  34.52 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  34.52 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  34.52 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  34.52 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  35.53 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  32.68 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  32.04 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  31.22 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  32.06 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  31.98 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  30.24 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  30.23 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  30.84 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  25.71 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  32.93 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.96 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  27 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  26.92 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  26.92 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  35.43 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  24.71 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  26.5 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  26.5 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  29.61 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  33.55 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.29 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  29.39 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  29.84 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  27.59 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  34.17 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  34.06 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  30.58 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  31.68 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  28.31 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  25.24 
 
 		 348 aa  72  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  28.25 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  25.71 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  32.2 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  32.2 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  32.2 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  31.63 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  21.67 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  21.67 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  28.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  28.5 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  27.46 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  31.86 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  31.43 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  29.75 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  28.71 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  26.44 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.53 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  27.27 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  27.27 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  32.59 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>