More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0584 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
405 aa  840    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.81 
 
 
404 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
405 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
405 aa  621  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.39 
 
 
406 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 
404 aa  594  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 
400 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 
400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.85 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 
400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 
400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 
400 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.99 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 
400 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.82 
 
 
400 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 
400 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 
400 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
400 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 
404 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 
404 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.35 
 
 
400 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 
400 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.36 
 
 
391 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 
404 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
402 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
403 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
403 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
359 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
330 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
329 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
327 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
392 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
327 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
329 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
342 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
340 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
340 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
330 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
331 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
327 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
331 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
329 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
331 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  38 
 
 
333 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
328 aa  269  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
328 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
348 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
340 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  36.59 
 
 
331 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 
329 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 
326 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
373 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
340 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.34 
 
 
330 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
330 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 
324 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 
329 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 
329 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 
327 aa  229  9e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
331 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
329 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 
326 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 
328 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 
328 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
351 aa  206  9e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
325 aa  203  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.5 
 
 
340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
323 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
323 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
323 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
335 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
335 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 
339 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 
334 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  33 
 
 
332 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
348 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>