More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0537 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
445 aa  902  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  49.89 
 
 
441 aa  415  1e-115  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  36.92 
 
 
445 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  39.72 
 
 
437 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  36.29 
 
 
446 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  39.53 
 
 
437 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  39.53 
 
 
439 aa  254  2e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  39 
 
 
437 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  35.42 
 
 
447 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  32.2 
 
 
441 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  33.73 
 
 
437 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  33.58 
 
 
438 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  35.1 
 
 
442 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  35.65 
 
 
447 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  37.09 
 
 
434 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  33.84 
 
 
440 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  34.14 
 
 
428 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  33.66 
 
 
428 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.96 
 
 
439 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 
428 aa  215  2e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.44 
 
 
444 aa  214  3e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  29.83 
 
 
439 aa  213  5e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  31.92 
 
 
426 aa  213  6e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  31.92 
 
 
426 aa  213  8e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  30.17 
 
 
439 aa  212  9e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  31.03 
 
 
433 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  30.99 
 
 
475 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  36.81 
 
 
446 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  34.26 
 
 
454 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  33.42 
 
 
451 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  36.27 
 
 
441 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  36.18 
 
 
446 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  34.98 
 
 
459 aa  202  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  33.73 
 
 
439 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.81 
 
 
436 aa  199  1e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  31.06 
 
 
425 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  32.58 
 
 
454 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  35.75 
 
 
437 aa  197  4e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  35.64 
 
 
437 aa  196  8e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  30.94 
 
 
455 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  30.94 
 
 
455 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  28.96 
 
 
454 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.01 
 
 
437 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.41 
 
 
448 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.66 
 
 
448 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  31.21 
 
 
450 aa  190  6e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  33.99 
 
 
467 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  36.34 
 
 
437 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.59 
 
 
434 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.71 
 
 
442 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  31.06 
 
 
441 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.75 
 
 
453 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 
445 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  33.5 
 
 
420 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  37.04 
 
 
399 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  35.28 
 
 
420 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  30.35 
 
 
418 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  33.87 
 
 
430 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 
440 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  36.59 
 
 
448 aa  176  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  32.73 
 
 
439 aa  175  1e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  31.77 
 
 
422 aa  175  1e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  31.85 
 
 
430 aa  174  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  31.53 
 
 
422 aa  174  2e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 
440 aa  174  3e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.78 
 
 
423 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 
440 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  30.45 
 
 
435 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  29.59 
 
 
419 aa  173  6e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  1.91252e-09 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  31.16 
 
 
434 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  27.43 
 
 
453 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 
448 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  31.55 
 
 
426 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  32.84 
 
 
440 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  30.4 
 
 
444 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  33.5 
 
 
440 aa  167  3e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  34.53 
 
 
427 aa  167  3e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  33.41 
 
 
427 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.94 
 
 
444 aa  166  6e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.46 
 
 
447 aa  165  1e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  34.53 
 
 
420 aa  165  2e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  34.66 
 
 
425 aa  164  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  33.08 
 
 
440 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  29.6 
 
 
423 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  30.81 
 
 
383 aa  162  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.27 
 
 
423 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.27 
 
 
423 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.27 
 
 
423 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.6 
 
 
423 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  32.52 
 
 
430 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  30.97 
 
 
430 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.99 
 
 
423 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.27 
 
 
423 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.27 
 
 
423 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.35 
 
 
423 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.88 
 
 
423 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>