More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0025 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  100 
 
 
238 aa  484  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  49.61 
 
 
259 aa  243  1e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  48.03 
 
 
259 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  49.02 
 
 
257 aa  233  1e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  30.57 
 
 
223 aa  128  9e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.27 
 
 
109 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  54.55 
 
 
108 aa  121  1e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  54.17 
 
 
106 aa  120  2e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  55.56 
 
 
106 aa  120  2e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  58.59 
 
 
115 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  54.55 
 
 
120 aa  119  5e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  119  5e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  119  5e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  50.98 
 
 
105 aa  118  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  49.52 
 
 
114 aa  117  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.51 
 
 
109 aa  117  1e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.49 
 
 
109 aa  117  1e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  51.96 
 
 
114 aa  117  2e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  47.12 
 
 
110 aa  117  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  54 
 
 
108 aa  117  2e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  45.19 
 
 
112 aa  116  4e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.48 
 
 
124 aa  116  4e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  115  4e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.73 
 
 
148 aa  116  4e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  47.66 
 
 
109 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  54.95 
 
 
109 aa  114  9e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  114  1e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  48 
 
 
107 aa  114  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  54.08 
 
 
106 aa  114  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  114  1e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  48.51 
 
 
104 aa  113  2e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  113  2e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  48.51 
 
 
104 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  48 
 
 
107 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  48.51 
 
 
104 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  48 
 
 
107 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  48 
 
 
107 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  49.53 
 
 
109 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  48.04 
 
 
109 aa  112  4e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  54.46 
 
 
110 aa  112  4e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.76 
 
 
107 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46 
 
 
107 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48 
 
 
109 aa  112  7e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  112  7e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  112  7e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  111  8e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  45.92 
 
 
109 aa  111  8e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  47.12 
 
 
110 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  47.12 
 
 
110 aa  111  1e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  47.62 
 
 
112 aa  111  1e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.76 
 
 
110 aa  110  1e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.54 
 
 
123 aa  110  2e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.53 
 
 
109 aa  110  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46 
 
 
107 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  45.92 
 
 
110 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  50.53 
 
 
109 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  50.51 
 
 
110 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  109  4e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  52.08 
 
 
106 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  46.67 
 
 
109 aa  108  7e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  44.55 
 
 
108 aa  108  8e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  51.65 
 
 
107 aa  108  9e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  49.49 
 
 
107 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  50.53 
 
 
107 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  51.06 
 
 
113 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  48 
 
 
109 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.90247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  52.81 
 
 
109 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45 
 
 
125 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  50.55 
 
 
107 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  48 
 
 
109 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  49.02 
 
 
106 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  46.53 
 
 
109 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  47.47 
 
 
105 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  48.35 
 
 
109 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  47.57 
 
 
154 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  45.54 
 
 
109 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.30614e-09  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  47.52 
 
 
109 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.45924e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  50.55 
 
 
107 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  54.44 
 
 
101 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  48.35 
 
 
138 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  47.62 
 
 
235 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  51.11 
 
 
109 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  55.68 
 
 
105 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  49.45 
 
 
105 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  51.11 
 
 
109 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  48.45 
 
 
106 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  49.51 
 
 
282 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  3.62321e-07  hitchhiker  2.55831e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  47.96 
 
 
106 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  51.65 
 
 
105 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>