106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1142 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  38.24 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.65 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  38.24 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.29 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 72 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.76 
 
 		 329 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.71 
 
 		 331 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  23.53 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.71 
 
 		 347 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  29.41 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  30.3 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.82 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 69 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  36.11 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  27.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  26.47 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.88 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  35.21 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>