More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0753 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0762  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  92.11 
 
 
612 aa  1103    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136316  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
633 aa  1251    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000430257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.46 
 
 
667 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.88 
 
 
648 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.35 
 
 
667 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.09 
 
 
641 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.21 
 
 
634 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.25 
 
 
667 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.79 
 
 
666 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.24 
 
 
676 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.64 
 
 
675 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  38.15 
 
 
636 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  35.15 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  36.46 
 
 
650 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.54 
 
 
628 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  34.99 
 
 
682 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  35.29 
 
 
679 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  36.05 
 
 
692 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  35.15 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.65 
 
 
653 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  35 
 
 
679 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.41 
 
 
671 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.3 
 
 
672 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  34.7 
 
 
670 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  35 
 
 
679 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.2 
 
 
678 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  34.49 
 
 
692 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  37.37 
 
 
663 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.01 
 
 
642 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.22 
 
 
674 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  35 
 
 
679 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  35 
 
 
679 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  34.76 
 
 
686 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  36.31 
 
 
661 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.64 
 
 
679 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  34.2 
 
 
695 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.01 
 
 
642 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.1 
 
 
671 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  35.87 
 
 
662 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.54 
 
 
678 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.74 
 
 
637 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.83 
 
 
630 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  36.46 
 
 
661 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.54 
 
 
652 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  34.6 
 
 
684 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  34.93 
 
 
695 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  34.31 
 
 
684 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 
684 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  34.89 
 
 
684 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  36.83 
 
 
621 aa  365  1e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  34.6 
 
 
684 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  34.6 
 
 
684 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  34.6 
 
 
684 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  35.56 
 
 
694 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  34.08 
 
 
682 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
673 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.05 
 
 
675 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.57 
 
 
666 aa  364  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  35.01 
 
 
686 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  35.16 
 
 
686 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.78 
 
 
702 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.8 
 
 
646 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  36.68 
 
 
643 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  34.53 
 
 
664 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.19 
 
 
650 aa  361  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.96 
 
 
643 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  33.85 
 
 
685 aa  360  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  34.25 
 
 
689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  35.77 
 
 
664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  35.27 
 
 
666 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.91 
 
 
670 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  40.07 
 
 
620 aa  357  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  37.85 
 
 
701 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.58 
 
 
704 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.07 
 
 
668 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  37.44 
 
 
697 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  37.91 
 
 
612 aa  355  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.09 
 
 
639 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.94 
 
 
666 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.94 
 
 
681 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36.42 
 
 
657 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  34.64 
 
 
689 aa  352  8.999999999999999e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36.26 
 
 
657 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
660 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  37.11 
 
 
688 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.5 
 
 
654 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  40.6 
 
 
620 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.76 
 
 
686 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  35.45 
 
 
654 aa  351  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  34.74 
 
 
654 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  35.81 
 
 
666 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  33.7 
 
 
724 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  39.61 
 
 
620 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  39.61 
 
 
620 aa  349  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
620 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.2 
 
 
658 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.49 
 
 
705 aa  349  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.43 
 
 
624 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.14 
 
 
685 aa  348  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  38.94 
 
 
620 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>