198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0807 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  100 
 
 
378 aa  797  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  40.21 
 
 
366 aa  285  1e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  41.83 
 
 
366 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  41.83 
 
 
366 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  41.55 
 
 
366 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  42.65 
 
 
386 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  4.48194e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  41.55 
 
 
366 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  41.55 
 
 
366 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  41.55 
 
 
366 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  41.55 
 
 
366 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  41.26 
 
 
366 aa  275  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  39.72 
 
 
364 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  38.59 
 
 
364 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  39.39 
 
 
368 aa  259  5e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.19 
 
 
392 aa  254  2e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  40.68 
 
 
389 aa  253  4e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  37.64 
 
 
392 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  35.6 
 
 
394 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.6 
 
 
394 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.6 
 
 
394 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.6 
 
 
394 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.61 
 
 
394 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  35 
 
 
390 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  35.58 
 
 
391 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35 
 
 
390 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  35 
 
 
390 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35 
 
 
390 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  35 
 
 
390 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  34.74 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  34.74 
 
 
390 aa  234  2e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  34.74 
 
 
390 aa  234  2e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  36.18 
 
 
392 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  34.83 
 
 
385 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4219  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  33.15 
 
 
359 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  29.67 
 
 
361 aa  201  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  32.44 
 
 
392 aa  196  5e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  32.44 
 
 
392 aa  196  5e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  32.09 
 
 
389 aa  196  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  32.17 
 
 
392 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  32.17 
 
 
392 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  32.17 
 
 
392 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.9 
 
 
392 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.9 
 
 
392 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.9 
 
 
392 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.64 
 
 
392 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  30.87 
 
 
392 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.26 
 
 
392 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.77 
 
 
392 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.56 
 
 
392 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0988  tetraheme cytochrome c  30.81 
 
 
391 aa  183  4e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  30.29 
 
 
392 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  29.89 
 
 
392 aa  174  2e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  29.84 
 
 
394 aa  172  6e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2730  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.05 
 
 
407 aa  165  1e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  49.08 
 
 
603 aa  164  2e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  29.57 
 
 
383 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.68 
 
 
411 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.460429  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  38.16 
 
 
237 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.32 
 
 
203 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  40.21 
 
 
195 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  39.16 
 
 
200 aa  142  1e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.9 
 
 
202 aa  140  2e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  43.21 
 
 
203 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  140  4e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  37.13 
 
 
196 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  38.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  42.33 
 
 
191 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4765  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  39.77 
 
 
195 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.719721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2425  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40.59 
 
 
199 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4061  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome NapC/NirT  39.05 
 
 
195 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418249  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1938  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40.83 
 
 
195 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00561646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1905  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40 
 
 
195 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1902  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.24 
 
 
195 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.526119  hitchhiker  8.39402e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2133  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.24 
 
 
195 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1844  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.24 
 
 
195 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  hitchhiker  0.000210051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4207  cytochrome c-type protein NapC  40.83 
 
 
198 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2381  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  40.24 
 
 
195 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000554571  normal  0.329531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0086  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  41.82 
 
 
171 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1945  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40.24 
 
 
195 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  40.61 
 
 
200 aa  136  6e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1624  periplasmic nitrate reductase C-type cytochrome, NapC/NirT  40.24 
 
 
195 aa  136  6e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.123114  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  40 
 
 
200 aa  136  6e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  39.76 
 
 
199 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  39.76 
 
 
200 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  39.76 
 
 
199 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1912  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40.24 
 
 
195 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00847918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49270  cytochrome c-type protein NapC  39.64 
 
 
198 aa  134  2e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0776862  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  40.33 
 
 
192 aa  134  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5182  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  42.51 
 
 
233 aa  134  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.477551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>