More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0390 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  73.13 
 
 		 466 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  74.52 
 
 		 466 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  74.52 
 
 		 466 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  70.26 
 
 		 466 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  70.56 
 
 		 474 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  72.29 
 
 		 471 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  70.47 
 
 		 474 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  69.61 
 
 		 466 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.35 
 
 		 466 aa  704    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  70.78 
 
 		 468 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  70.78 
 
 		 468 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 466 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  71 
 
 		 468 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  73.33 
 
 		 476 aa  707    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  73.13 
 
 		 466 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  69.83 
 
 		 466 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  73.33 
 
 		 476 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  74.3 
 
 		 466 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  74.3 
 
 		 466 aa  713    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  74.3 
 
 		 466 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  70.78 
 
 		 468 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 466 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 466 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  70.04 
 
 		 466 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  74.52 
 
 		 466 aa  713    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  74.3 
 
 		 466 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.99 
 
 		 466 aa  712    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  68.18 
 
 		 482 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  74.52 
 
 		 466 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  74.52 
 
 		 466 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.81 
 
 		 466 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 466 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  73.59 
 
 		 467 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 469 aa  973    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  70.13 
 
 		 474 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  70 
 
 		 474 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  68.61 
 
 		 470 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  74.52 
 
 		 466 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 466 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  69.91 
 
 		 474 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  73.33 
 
 		 476 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  68.97 
 
 		 470 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  72.59 
 
 		 466 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  72.63 
 
 		 466 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  68.16 
 
 		 466 aa  628  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  65.87 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  62.93 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3071  isopropylmalate isomerase large subunit  62.8 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  61.42 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  62.61 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  62.21 
 
 		 477 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  64.15 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  63.36 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  62.61 
 
 		 469 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  62.82 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 477 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  61.97 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  61.94 
 
 		 469 aa  591  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  61.97 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  62.82 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3270  isopropylmalate isomerase large subunit  64.96 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  61.97 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.03 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  61.97 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  62.63 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  63.12 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.83 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  62.02 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  61.54 
 
 		 469 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  62.69 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  62.63 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  62.63 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  63.71 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  63.71 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.88 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  63.01 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  60.52 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 470 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  62.69 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  63.28 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  60.25 
 
 		 770 aa  585  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  63.62 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  63.62 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  63.54 
 
 		 473 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  63.4 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  61.32 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>