More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0862 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  100 
 
 		 499 aa  1004    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  70.44 
 
 		 477 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  38.68 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  40.67 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  34.48 
 
 		 461 aa  243  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  45.15 
 
 		 476 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  36.55 
 
 		 434 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  38.53 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  32.9 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  49.37 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  36.45 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  43.26 
 
 		 483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  35.5 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  35.33 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  35.75 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  35.75 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  35.75 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  42.32 
 
 		 484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  31.68 
 
 		 490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  35.2 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  48.7 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  43.35 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  43.46 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  45.53 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  36.36 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  36.47 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  33.05 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  49.79 
 
 		 537 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  34.66 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  35.08 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 465 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40.16 
 
 		 284 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  38.75 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 		 250 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  38.36 
 
 		 285 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  38.68 
 
 		 296 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  40.37 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  38.89 
 
 		 273 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.44 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  37.84 
 
 		 445 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  36.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  37.84 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.66 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 279 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 287 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  34.63 
 
 		 432 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  32.37 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 		 291 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  39.22 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.67 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.22 
 
 		 291 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.67 
 
 		 291 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.67 
 
 		 291 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.39 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 286 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  35.94 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 		 425 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.94 
 
 		 292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  35.89 
 
 		 278 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.62 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  37.14 
 
 		 273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 292 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  36.22 
 
 		 291 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  37.18 
 
 		 285 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.42 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.23 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  27.82 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.08 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  29.64 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.07 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.07 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  36.04 
 
 		 292 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.34 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  31.7 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  32.66 
 
 		 276 aa  143  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.23 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  37.75 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  31.65 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.08 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  30.09 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  31.65 
 
 		 283 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  36.64 
 
 		 285 aa  141  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>