168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1138 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  276  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  47.33 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  50.38 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  49.24 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  47.73 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  44.36 
 
 		 136 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  42.31 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  48.09 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  43.61 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  45.11 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  46.56 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  45.86 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  44.19 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  44.19 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  45.74 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  44.96 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  45.04 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  45.8 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  39.85 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  44.27 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  44.27 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  49.47 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  41.86 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  41.98 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  41.98 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  39.69 
 
 		 133 aa  93.2  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  41.22 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  39.53 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  41.09 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  38.93 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  37.98 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  40.46 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  39.1 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  37.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  40 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  40.15 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  37.59 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  40.31 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  42.42 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  36.43 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  38.93 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  38.76 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  40 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  40 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  42.11 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  44.68 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  41.59 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  38.76 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  39.85 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  40.43 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  41.04 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  34.62 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  36.61 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  42.71 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  39.47 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  35.61 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  39.36 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2281  PilT protein domain protein  39.36 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.913458  hitchhiker  0.0000308693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  39.09 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  30.53 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  39.09 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4794  PilT protein-like  42.71 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  35.51 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0795  PilT protein-like protein  39.58 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  38.54 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  34.13 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  32.79 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  30.5 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  32.56 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  38.95 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  29.55 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  30.7 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.81 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  30.22 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  36.84 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  37.18 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  28.26 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>