More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4666 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  100 
 
 		 450 aa  857    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  49.66 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  46.3 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  46.3 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  46.3 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  44.76 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  45.73 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  45.75 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  44.06 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  43.33 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  42.75 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  43.17 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  46.67 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.03 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  46.04 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.09 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.75 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  39 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  44.78 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.05 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.86 
 
 		 407 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.94 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.62 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.62 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  40.15 
 
 		 410 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.21 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.16 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.22 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.45 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  37.5 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.35 
 
 		 407 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.35 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.91 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.84 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.44 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.63 
 
 		 405 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  37.44 
 
 		 405 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.67 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.14 
 
 		 398 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  39.15 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  45.26 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  38.78 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.92 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  38.52 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40.44 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  40.2 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  39.58 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.54 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  40.8 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.32 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.59 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  38.27 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.2 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.83 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.85 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.85 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.54 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.56 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.92 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.84 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.23 
 
 		 411 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.8 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  41.12 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.23 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.46 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.23 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  41.8 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  41.18 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  42.11 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.95 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.61 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.67 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.41 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.32 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.29 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  38.4 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.08 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.27 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.61 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.07 
 
 		 400 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  37.41 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  35.31 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.65 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  42.11 
 
 		 411 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.14 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  38.37 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.26 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  39.51 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  38.64 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.87 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  35.53 
 
 		 401 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.98 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  40 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.22 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  37.32 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.82 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.49 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  35.53 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  37.81 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.62 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>