More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4142 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 275 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  45.35 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  46.83 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  45.88 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  45.21 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  43.75 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  42.54 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  44.09 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  40.58 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  42.32 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  40.74 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  39.69 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  41.47 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  39.92 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  38.8 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  38.61 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  40.51 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  39.93 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  38.27 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  39.05 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  37.45 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  41.7 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  37.5 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  36.61 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  35.43 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  40.15 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  38.91 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  34.87 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.4 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  37.18 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  37.45 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  37.21 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  37.02 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  36.4 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  37.28 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  37.72 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  38.08 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  37.71 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  38.03 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  34.32 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.27 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  34.94 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  34.58 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.42 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  36.75 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  37.24 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  37.17 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  38.49 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  36.07 
 
 		 364 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.2 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  36.75 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  35.4 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  39.83 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 		 241 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  35.34 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  30.55 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  35.11 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 		 406 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  33.2 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  37.82 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  35.22 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  31.17 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  31.91 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  29.87 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  35.93 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 		 355 aa  95.9  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.54 
 
 		 361 aa  95.9  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 		 207 aa  95.9  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.43 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  33.47 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  28.81 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  28.57 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 		 341 aa  86.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  29.39 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.88 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  27.16 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>