More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0394 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
364 aa  719    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 
363 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
361 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
351 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
321 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
280 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.95 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  34.82 
 
 
321 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
353 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
274 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
1250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
367 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
305 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.4 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
352 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
306 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
334 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
336 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
277 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
310 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
365 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
338 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.93 
 
 
341 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
364 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.18 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.53 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
380 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
339 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
283 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
345 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
342 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
294 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
398 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
303 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
261 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
349 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.52 
 
 
255 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.11 
 
 
272 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
295 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.44 
 
 
327 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.71 
 
 
312 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2388  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
332 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.416344  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
338 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 
262 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
321 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
347 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
376 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
373 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
466 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
1032 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
280 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
344 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
304 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
291 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
256 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
727 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
1035 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
581 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
336 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.53 
 
 
341 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
350 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
334 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
358 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.08 
 
 
294 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
384 aa  99.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
324 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
374 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
331 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
322 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
930 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.92 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
331 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
250 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
597 aa  96.3  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>