More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0487 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 399 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  67.82 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  64.51 
 
 		 357 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  60.47 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  59.76 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  53.91 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.88 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  41.97 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.94 
 
 		 852 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  41.08 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  41.36 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  41.08 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  34.53 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  37.39 
 
 		 863 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  33.62 
 
 		 354 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 864 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  39.27 
 
 		 863 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  32.03 
 
 		 358 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  31.75 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.36 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  40.68 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.44 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.46 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  37.85 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.32 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.78 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.89 
 
 		 364 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  40.06 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  40.06 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 356 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.96 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.69 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.58 
 
 		 498 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.49 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  38.67 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.78 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.38 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  38.38 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.14 
 
 		 496 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.35 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.46 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.26 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  36.47 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.43 
 
 		 498 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.74 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.15 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  34.42 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  30.16 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  28.05 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  34.74 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  33.52 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  33.8 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  27.52 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 371 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  29 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  36.71 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  28.88 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  34.23 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.6 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.81 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.98 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  32.57 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.56 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  28.97 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.87 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  36.26 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.5 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  35.39 
 
 		 858 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.34 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.52 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 		 355 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.01 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  33.53 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  35.41 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.06 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.78 
 
 		 848 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>