165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4579 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 349 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  72.29 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  72.29 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  71.99 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  57.23 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  49.56 
 
 		 348 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  50.9 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  50.16 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  50.16 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  47.76 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  46.47 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  49.26 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  47.9 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  46.55 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  48.34 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  46.88 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  48.18 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  45.18 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  47.59 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  45.48 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  45.81 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  48.63 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  45.48 
 
 		 334 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  45.18 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.79 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.48 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.34 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  38.14 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  35.69 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  36.29 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  35.76 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  34.31 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  37.09 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  35.76 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  53.46 
 
 		 281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  34.01 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  35.91 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  33.9 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.79 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.75 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  35.64 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  36.15 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  36.86 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  36.86 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  36.86 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  31.62 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  32.33 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  34.09 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  32.89 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  32.18 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.76 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.48 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.74 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  34.38 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.37 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  35.37 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.11 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  34.44 
 
 		 319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  31.93 
 
 		 312 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.15 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  30.85 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.34 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  32.2 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.63 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.18 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  32.2 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.55 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  31.82 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  33.7 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  29.76 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  27.89 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  29.84 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.57 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.77 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  31.97 
 
 		 233 aa  93.2  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  34.39 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  27.61 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  35.33 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  35.33 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  31.09 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>