More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3282 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 433 aa  864    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  96.07 
 
 		 439 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  68.29 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  65.97 
 
 		 447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  67.61 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  57.01 
 
 		 456 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  58.28 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  36.11 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.64 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.3 
 
 		 479 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  35.39 
 
 		 420 aa  252  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.68 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  31.58 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  34.71 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  36.63 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  36.54 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.64 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  36.06 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  35.15 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.15 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  30.8 
 
 		 441 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  34.62 
 
 		 464 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.69 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.94 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.71 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  33.71 
 
 		 436 aa  233  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.71 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.71 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.71 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.71 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.18 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.78 
 
 		 440 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  34.3 
 
 		 477 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  31.4 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  32.48 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  31.31 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.23 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  32.96 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.68 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  32.53 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  34.68 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2102  hypothetical protein  32.52 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0719505  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  32.77 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  32 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.1 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  32.96 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  32.78 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  35.75 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  32.75 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  34.05 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.38 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  34.59 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.36 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  31.94 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  35.45 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  34.33 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.52 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  35.59 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.41 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  33.83 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  29.91 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  32.04 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.65 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.18 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  33.42 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  31.34 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  34.16 
 
 		 431 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  32 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  34.76 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  34.76 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.78 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.35 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  32.18 
 
 		 442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  31.65 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  31.71 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.1 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  32.68 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 		 477 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  33.98 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  32.92 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>