More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1020 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
226 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  97.13 
 
 
233 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  72.12 
 
 
227 aa  353  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  70.42 
 
 
229 aa  324  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  65.18 
 
 
225 aa  310  8e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.93 
 
 
225 aa  309  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  66.96 
 
 
227 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  64.29 
 
 
225 aa  306  2e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.44 
 
 
229 aa  304  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  65.78 
 
 
245 aa  303  1e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  66.07 
 
 
225 aa  301  5e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  64 
 
 
227 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  64.29 
 
 
225 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.62 
 
 
230 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  64.6 
 
 
226 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  64.16 
 
 
227 aa  297  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  65.78 
 
 
228 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.78 
 
 
228 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  59.56 
 
 
225 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  63.23 
 
 
226 aa  292  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  64.16 
 
 
233 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.89 
 
 
224 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.57 
 
 
224 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  64.57 
 
 
230 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.89 
 
 
228 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.95 
 
 
228 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  60.62 
 
 
225 aa  288  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.64 
 
 
227 aa  288  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  60.54 
 
 
232 aa  289  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  60.62 
 
 
225 aa  288  5e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  62.95 
 
 
225 aa  287  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.38 
 
 
229 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  61.95 
 
 
225 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  61.61 
 
 
231 aa  285  3e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  59.56 
 
 
267 aa  285  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.11 
 
 
231 aa  285  6e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.89 
 
 
228 aa  282  2e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  61.99 
 
 
230 aa  283  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.29 
 
 
232 aa  281  7e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  59.56 
 
 
230 aa  281  7e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.29 
 
 
230 aa  281  8e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  59.29 
 
 
230 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.27 
 
 
225 aa  279  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58.85 
 
 
230 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  61.78 
 
 
227 aa  278  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  57.78 
 
 
226 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58.85 
 
 
230 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  61.95 
 
 
227 aa  277  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.24 
 
 
228 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  58.48 
 
 
230 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.25 
 
 
225 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.46139e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.78 
 
 
227 aa  273  1e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.76 
 
 
225 aa  273  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.44 
 
 
227 aa  269  3e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  56.7 
 
 
246 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  56.25 
 
 
229 aa  267  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  62.05 
 
 
225 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  64.29 
 
 
229 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.67 
 
 
228 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.22 
 
 
228 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  66.22 
 
 
228 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  56.05 
 
 
227 aa  260  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  56.05 
 
 
223 aa  258  5e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  55.61 
 
 
230 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  55.16 
 
 
230 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.58 
 
 
242 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  49.32 
 
 
257 aa  225  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  47.14 
 
 
267 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 
238 aa  199  4e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  47.79 
 
 
223 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.54 
 
 
232 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  49.55 
 
 
226 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.58 
 
 
231 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.33 
 
 
255 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  41.26 
 
 
224 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  45.54 
 
 
224 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  45.58 
 
 
230 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  42.29 
 
 
221 aa  178  6e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  42.41 
 
 
224 aa  174  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  45 
 
 
220 aa  174  1e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 
237 aa  173  2e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  41.52 
 
 
221 aa  173  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  44.09 
 
 
220 aa  171  6e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.41 
 
 
231 aa  171  7e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  45.18 
 
 
231 aa  171  8e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  38.53 
 
 
228 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  43.64 
 
 
219 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  43.64 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  43.64 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  38.39 
 
 
219 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  42.22 
 
 
220 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  43.3 
 
 
229 aa  167  8e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  43.4 
 
 
237 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  43.5 
 
 
234 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0260674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>