40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0058 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  100 
 
 		 227 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  70.93 
 
 		 228 aa  341  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  66.08 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  40.25 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  42.44 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  37.39 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  36.44 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  31.03 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  31.72 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  28.89 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  31.21 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  28.26 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  29.89 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  31.72 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  28.87 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  31.03 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  28.37 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  33.09 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  30.07 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  29.41 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  27.75 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  26 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  30.17 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  29.63 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  26.73 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  26.81 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  25.24 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  27.66 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  27.41 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  27.64 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  26.81 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0434  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.38 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  27.54 
 
 		 235 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  26.5 
 
 		 235 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  27.54 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  27.54 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>