More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1498 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  79.85 
 
 		 530 aa  901    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 531 aa  1095    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  47.07 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00896755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 		 532 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3355  AMP-dependent synthetase and ligase  44.47 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 538 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 		 540 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 		 560 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2165  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8058  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0056  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0588  AMP-dependent synthetase and ligase  43.82 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2009  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  43.38 
 
 		 548 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2139  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00340714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  43.49 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  43 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  42.8 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  42.41 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  41.84 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  41.97 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  42.69 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3817  acyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  41.78 
 
 		 540 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0030  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  41.41 
 
 		 549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0550813  normal  0.598947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4913  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 549 aa  359  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  41.48 
 
 		 547 aa  359  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 549 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  39.66 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 548 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6026  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 550 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6506  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 545 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1658  acyl-CoA synthetase  41 
 
 		 542 aa  353  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.125326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 		 545 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5939  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0683  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000214245  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 551 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 550 aa  348  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  37.92 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  39.77 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  39.53 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 533 aa  347  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  346  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4911  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2536  acyl-CoA synthetase  39.35 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.3 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.18 
 
 		 542 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  40.27 
 
 		 542 aa  339  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 548 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6221  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 549 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6109  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  40.58 
 
 		 544 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 542 aa  336  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591871  normal  0.469505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  40.58 
 
 		 544 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  41.41 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.34 
 
 		 545 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 546 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 539 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0833  AMP-dependent synthetase and ligase  40.27 
 
 		 541 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0919846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.08 
 
 		 545 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0226  acyl-CoA synthetase  38.78 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1565  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 		 543 aa  332  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 544 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.2 
 
 		 542 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 556 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.2 
 
 		 542 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  38.14 
 
 		 554 aa  329  7e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  40 
 
 		 544 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.31 
 
 		 545 aa  329  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 542 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>