More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1405 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  72.7 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  55.63 
 
 		 314 aa  333  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 314 aa  332  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  55.63 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  55.28 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  54.93 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  54.93 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  56.34 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  45.57 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  44.92 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.83 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  45.13 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  43.77 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  44.16 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  41.31 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  42.48 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  45.39 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  44.41 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  44.48 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  43.61 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  43.51 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  43.18 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  42.58 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  42.58 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  42.58 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  42.58 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  45.07 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  41.97 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  42.05 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  43.38 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  44.22 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  43.83 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  42.91 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  39.74 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  40.78 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  40.13 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  41.48 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  39.14 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  40.69 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  40.65 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  35.55 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  35.1 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.95 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1723  2-dehydropantoate 2-reductase  52.68 
 
 		 127 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  23.94 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.06 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1046  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0275779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  25.33 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  24.48 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>