More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1002 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  79.84 
 
 
262 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  65.62 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  65.62 
 
 
263 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  65.62 
 
 
263 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  65.62 
 
 
263 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  65.23 
 
 
263 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  65.23 
 
 
263 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  65.23 
 
 
263 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  62.16 
 
 
263 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  64.84 
 
 
263 aa  351  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  64.45 
 
 
263 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  64.45 
 
 
263 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  44.62 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  46.61 
 
 
260 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  46.34 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  46 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  44.4 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  44.02 
 
 
320 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  44.02 
 
 
320 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  41.67 
 
 
272 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  43.08 
 
 
324 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  42.75 
 
 
311 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  41.04 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  39.84 
 
 
302 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  41.06 
 
 
320 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  40.34 
 
 
323 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  39.76 
 
 
315 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  39.68 
 
 
318 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  39.68 
 
 
318 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  39.45 
 
 
301 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  39.37 
 
 
317 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  39.52 
 
 
252 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  38.28 
 
 
323 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  40 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  38.97 
 
 
323 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.75 
 
 
306 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.75 
 
 
305 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.75 
 
 
305 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  39.61 
 
 
302 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  40.08 
 
 
316 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  41.77 
 
 
298 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  39.61 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  39.22 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  39.61 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  39.61 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  39.61 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  40.83 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  39.61 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  39.22 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  39.22 
 
 
358 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  39.22 
 
 
349 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  38.64 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  39.33 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  37.65 
 
 
259 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.8 
 
 
330 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  38.55 
 
 
308 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.96 
 
 
275 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  37.11 
 
 
728 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  37.67 
 
 
310 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  38.14 
 
 
728 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  41.48 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  36.77 
 
 
751 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  38.55 
 
 
346 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  38.35 
 
 
777 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.08 
 
 
727 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.57 
 
 
750 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  36.72 
 
 
346 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  35.48 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  36.09 
 
 
753 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  39.29 
 
 
741 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  36.84 
 
 
335 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  37.6 
 
 
346 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.21 
 
 
275 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.8 
 
 
275 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  40.35 
 
 
327 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  36.64 
 
 
733 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  47.49 
 
 
287 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  35.92 
 
 
334 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  40.52 
 
 
813 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  39.41 
 
 
803 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  39.41 
 
 
803 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  36.81 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  38.03 
 
 
728 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  39.41 
 
 
804 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  38.4 
 
 
345 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  36.84 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  37.63 
 
 
803 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  38.03 
 
 
920 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.42 
 
 
322 aa  165  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  36.36 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  38.03 
 
 
930 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  38.03 
 
 
945 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  38.03 
 
 
933 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  39.03 
 
 
796 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  36.04 
 
 
316 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  37.92 
 
 
347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  37.92 
 
 
347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  37.98 
 
 
738 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  38.15 
 
 
852 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>