More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0369 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 225 aa  88.2  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.95 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.69 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.82 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.33 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.64 
 
 		 444 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.54 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.54 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.54 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.94 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.39 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  30.86 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.54 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.72 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.94 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.97 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  29.94 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.25 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.94 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.79 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  28.22 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  29.07 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  29.07 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  29.5 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.67 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.67 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  27.59 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  29.94 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  23.41 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  28.04 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  28.49 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  27 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.9 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.05 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 440 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 402 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.13 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  25.76 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>