113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1850 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  99.19 
 
 
248 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  84.27 
 
 
248 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  84.27 
 
 
248 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  84.27 
 
 
248 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  83.87 
 
 
274 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  83.87 
 
 
274 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  72.18 
 
 
248 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  56.63 
 
 
256 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.61478e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  56.63 
 
 
256 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.89285e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  56.63 
 
 
273 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.66286e-06  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  54.88 
 
 
254 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  53.82 
 
 
249 aa  274  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  54.4 
 
 
249 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  51.81 
 
 
249 aa  265  6e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  48.59 
 
 
249 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  48.56 
 
 
250 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  39.84 
 
 
246 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  37.96 
 
 
246 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  37.55 
 
 
246 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  37.55 
 
 
246 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  37.96 
 
 
246 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  37.55 
 
 
246 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  37.55 
 
 
246 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  37.55 
 
 
246 aa  184  1e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  37.55 
 
 
246 aa  184  1e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  33.47 
 
 
250 aa  139  4e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  33.92 
 
 
270 aa  138  8e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  33.04 
 
 
270 aa  134  1e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  35.43 
 
 
272 aa  130  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  34.67 
 
 
263 aa  128  9e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.37839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  29.88 
 
 
250 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  33.33 
 
 
259 aa  119  4e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  33.33 
 
 
259 aa  114  1e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  29.96 
 
 
255 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  25.26 
 
 
292 aa  85.1  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  25.08 
 
 
294 aa  83.6  3e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  28.15 
 
 
245 aa  80.9  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  80.1  3e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  28.29 
 
 
311 aa  79.3  5e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  26.46 
 
 
291 aa  77  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
247 aa  75.9  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
257 aa  75.1  9e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  22.5 
 
 
287 aa  74.7  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  23.69 
 
 
287 aa  73.6  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  23.68 
 
 
253 aa  72.8  5e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  23.26 
 
 
304 aa  72.8  5e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 
288 aa  72.8  5e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  27.42 
 
 
294 aa  72.4  7e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  29.91 
 
 
267 aa  72  8e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  25.65 
 
 
497 aa  71.6  1e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  23.9 
 
 
244 aa  70.9  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  23.69 
 
 
304 aa  69.7  4e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  26.91 
 
 
252 aa  68.9  6e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  22.98 
 
 
287 aa  68.9  7e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  27.8 
 
 
491 aa  68.2  1e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  22.98 
 
 
287 aa  67.8  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  22.58 
 
 
304 aa  67.4  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  22.58 
 
 
268 aa  64.7  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.91613e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  26.99 
 
 
271 aa  65.1  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  23.64 
 
 
257 aa  64.3  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.54 
 
 
256 aa  63.9  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  26.01 
 
 
272 aa  63.9  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  26.55 
 
 
271 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  27.96 
 
 
254 aa  63.2  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.95 
 
 
255 aa  63.2  4e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  27.13 
 
 
256 aa  62.4  6e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24.5 
 
 
261 aa  62.4  6e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  23.9 
 
 
255 aa  62  9e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 
257 aa  59.3  6e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  22.78 
 
 
258 aa  56.2  5e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 
259 aa  55.8  6e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  25.17 
 
 
292 aa  54.7  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.15128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  24.61 
 
 
270 aa  53.1  3e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
327 aa  52.4  7e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.64413e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.64 
 
 
253 aa  50.1  3e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.47 
 
 
278 aa  49.7  4e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.17 
 
 
278 aa  48.9  7e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  23.77 
 
 
257 aa  48.9  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  23.77 
 
 
257 aa  48.9  8e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  22.83 
 
 
454 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  34.48 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  23.77 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
225 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  22.83 
 
 
466 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  23.4 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  23.4 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  24.18 
 
 
318 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  22.03 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  22.95 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  33.75 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>