44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0775 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 454 aa  940    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  71.8 
 
 		 460 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  68.37 
 
 		 466 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  47.82 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02508  hypothetical protein  46.1 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  45.54 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25.84 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  24.78 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25.66 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3546  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0041915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24.26 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  28.03 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  22.48 
 
 		 271 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  22.48 
 
 		 271 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  29.25 
 
 		 270 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 		 249 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  21.2 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  22.83 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  24.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  24.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  22.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  24.19 
 
 		 248 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  24.19 
 
 		 248 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  24.19 
 
 		 248 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 		 249 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.39 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 252 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  22.73 
 
 		 267 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  24.12 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  24.24 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  23.36 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  23.36 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  23.36 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  19.7 
 
 		 253 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  20.1 
 
 		 256 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>