More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3219 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  99.71 
 
 		 339 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  100 
 
 		 339 aa  700    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  99.71 
 
 		 339 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  55.63 
 
 		 329 aa  362  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  54.1 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  52.79 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  54.11 
 
 		 317 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  52.35 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  51.32 
 
 		 321 aa  318  9e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 319 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  46.82 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  47.06 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  47.06 
 
 		 315 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 315 aa  279  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  45.66 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  45.28 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  44.24 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.93 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.93 
 
 		 327 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  47.08 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  44.52 
 
 		 330 aa  272  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  45.28 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  45.42 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  47.23 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.58 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.56 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  45.85 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  44.72 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.71 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  48.08 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  46.03 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  42.73 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  44.23 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  46.58 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.1 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  43.91 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  48.56 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.09 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  45.26 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.6 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  43.32 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  42.55 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  43 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  47.56 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  43.92 
 
 		 317 aa  258  8e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.13 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  43.59 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  42.35 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  44.63 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  47.9 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  41.99 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  41.18 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  42.35 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  43.59 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  43 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.97 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  44.63 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  44.15 
 
 		 325 aa  255  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  47.56 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  45.82 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  42.76 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  41.75 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.52 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  43.62 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  47.33 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  43.62 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.27 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  43.73 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  42.63 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  44.88 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  44.55 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>