54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4098 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4098  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  7.07245e-09  hitchhiker  0.00136585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3151  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  4.14624e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0884  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.3918e-05  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02679  DNA mismatch repair protein  99.56 
 
 
229 aa  458  1e-128  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  5.79311e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3031  DNA mismatch repair protein  99.56 
 
 
229 aa  459  1e-128  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.33589e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2979  DNA mismatch repair protein  99.56 
 
 
229 aa  458  1e-128  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.62046e-07  decreased coverage  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02640  hypothetical protein  99.56 
 
 
229 aa  458  1e-128  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.02159e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2978  DNA mismatch repair protein  99.56 
 
 
229 aa  458  1e-128  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.65444e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0859  DNA mismatch repair endonuclease mutH  99.56 
 
 
229 aa  458  1e-128  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.02017e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3233  DNA mismatch repair protein  89.08 
 
 
231 aa  414  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.81601e-05  hitchhiker  4.00145e-06 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3218  DNA mismatch repair protein  89.08 
 
 
231 aa  414  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  6.31392e-05  hitchhiker  0.00373794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3169  DNA mismatch repair protein  89.08 
 
 
231 aa  414  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.66298e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3152  DNA mismatch repair protein  89.08 
 
 
231 aa  414  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.22313e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3333  DNA mismatch repair protein  89.08 
 
 
231 aa  414  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.94607e-05  hitchhiker  0.00919064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3273  DNA mismatch repair protein  84.82 
 
 
230 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.45556e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3825  DNA mismatch repair protein  76.68 
 
 
228 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.12374e-07  normal  0.472471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3199  DNA mismatch repair protein  75 
 
 
228 aa  349  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000169255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0903  DNA mismatch repair protein  73.57 
 
 
231 aa  342  3e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3400  DNA mismatch repair protein  72.25 
 
 
230 aa  340  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00030218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3242  DNA mismatch repair protein  73.18 
 
 
228 aa  337  1e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.70849e-11  normal  0.0183168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1032  DNA mismatch repair protein  73.18 
 
 
228 aa  337  1e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.09163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0980  DNA mismatch repair protein  73.18 
 
 
228 aa  337  1e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.87199e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3019  DNA mismatch repair protein  74.77 
 
 
228 aa  329  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  3.28639e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0541  DNA mismatch repair protein  67.58 
 
 
224 aa  313  1e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.962332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004432  DNA mismatch repair endonuclease MutH  65.9 
 
 
226 aa  305  4e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.91849e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00966  DNA mismatch repair protein  64.52 
 
 
226 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0568  DNA mismatch repair protein  64.98 
 
 
222 aa  294  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0200  DNA mismatch repair protein  63.43 
 
 
221 aa  292  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.725657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1037  DNA mismatch repair protein  61.75 
 
 
223 aa  283  2e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.3466e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1227  DNA mismatch repair protein  60.37 
 
 
223 aa  282  3e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.90302e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2866  DNA mismatch repair protein  59.46 
 
 
223 aa  282  4e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.04837e-09  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3130  DNA mismatch repair protein  59.91 
 
 
223 aa  281  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  8.66065e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3044  DNA mismatch repair protein  59.46 
 
 
223 aa  281  4e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.24269e-09  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1183  DNA mismatch repair protein  59.91 
 
 
223 aa  281  4e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.48416e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1260  DNA mismatch repair protein  59.91 
 
 
223 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.73996e-08  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2948  DNA mismatch repair protein  59.01 
 
 
223 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.86645e-07  normal  0.260318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1550  DNA mismatch repair protein  61.09 
 
 
224 aa  279  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1131  DNA mismatch repair protein  58.99 
 
 
224 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.41126e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1330  DNA mismatch repair protein  58.06 
 
 
223 aa  275  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1141  DNA mismatch repair protein  58.53 
 
 
223 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.91813e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1226  DNA mismatch repair protein  58.26 
 
 
231 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.02045e-08  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1020  DNA mismatch repair protein  57.99 
 
 
223 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.64463e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2783  DNA mismatch repair protein  59.26 
 
 
222 aa  268  3e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  8.62742e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0862  DNA mismatch repair protein  59.91 
 
 
224 aa  267  9e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.78549e-09  normal  0.0577392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03711  DNA mismatch repair protein  60.48 
 
 
225 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2946  DNA mismatch repair protein  57.34 
 
 
222 aa  265  3e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0152588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3626  DNA mismatch repair protein  56.31 
 
 
222 aa  264  9e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.544284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3848  DNA mismatch repair protein  53.33 
 
 
228 aa  262  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.662475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2831  DNA mismatch repair protein  58.45 
 
 
225 aa  259  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0501  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 
224 aa  254  1e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.56276  normal  0.0450922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1436  DNA mismatch repair protein  48.84 
 
 
224 aa  220  1e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1548  DNA mismatch repair protein  48.37 
 
 
224 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1358  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 
502 aa  50.8  2e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  2.49397e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1016  putative type II restriction endonuclease  24.35 
 
 
495 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.61814e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>