46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1358 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1358  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 502 aa  1045    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000249397  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0083  DNA mismatch repair enzyme MutH  48.65 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000253451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1016  putative type II restriction endonuclease  33.97 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000561814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1854  DNA mismatch repair enzyme MutH  34.28 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl307  type II restriction enzyme Sau3AI, GATC site  26.72 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000109234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1226  DNA mismatch repair protein  25.33 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000502045  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1548  DNA mismatch repair protein  26.79 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1131  DNA mismatch repair protein  25.25 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1436  DNA mismatch repair protein  25.56 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2946  DNA mismatch repair protein  25.51 
 
 		 222 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0501  DNA mismatch repair protein  24.79 
 
 		 224 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.56276  normal  0.0450922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0859  DNA mismatch repair endonuclease mutH  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4098  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000707245  hitchhiker  0.00136585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0884  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02640  hypothetical protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000402159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02679  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000579311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3151  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000414624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2978  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.65444e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2948  DNA mismatch repair protein  26.13 
 
 		 223 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  normal  0.260318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1227  DNA mismatch repair protein  25.74 
 
 		 223 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000990302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3273  DNA mismatch repair protein  25.38 
 
 		 230 aa  50.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000145556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1183  DNA mismatch repair protein  25.74 
 
 		 223 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000548416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3130  DNA mismatch repair protein  25.74 
 
 		 223 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000866065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1260  DNA mismatch repair protein  26.13 
 
 		 223 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000473996  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1020  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1037  DNA mismatch repair protein  23.61 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2783  DNA mismatch repair protein  25.32 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000862742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004432  DNA mismatch repair endonuclease MutH  24.66 
 
 		 226 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000291849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3031  DNA mismatch repair protein  22.84 
 
 		 229 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000733589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0568  DNA mismatch repair protein  24.87 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3825  DNA mismatch repair protein  23.56 
 
 		 228 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000312374  normal  0.472471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2979  DNA mismatch repair protein  22.84 
 
 		 229 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000162046  decreased coverage  0.00389286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1141  DNA mismatch repair protein  25.38 
 
 		 223 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000591813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3233  DNA mismatch repair protein  23.86 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000281601  hitchhiker  0.00000400145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3218  DNA mismatch repair protein  23.86 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000631392  hitchhiker  0.00373794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3169  DNA mismatch repair protein  23.86 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000166298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3152  DNA mismatch repair protein  23.86 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3333  DNA mismatch repair protein  23.86 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000194607  hitchhiker  0.00919064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3199  DNA mismatch repair protein  23.35 
 
 		 228 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000169255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00966  DNA mismatch repair protein  24.27 
 
 		 226 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3242  DNA mismatch repair protein  25.38 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000170849  normal  0.0183168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1330  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1032  DNA mismatch repair protein  25.38 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0980  DNA mismatch repair protein  25.38 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000587199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3044  DNA mismatch repair protein  24.62 
 
 		 223 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000824269  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2866  DNA mismatch repair protein  24.62 
 
 		 223 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.419127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>