59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3120 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  70.88 
 
 
1132 aa  1727    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  81.1 
 
 
1159 aa  1988    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  82.66 
 
 
1159 aa  2020    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  97.67 
 
 
1157 aa  2343    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  68.33 
 
 
1132 aa  1648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  63.97 
 
 
1116 aa  1382    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  68.78 
 
 
1120 aa  1480    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  64.17 
 
 
1116 aa  1386    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  68.98 
 
 
1120 aa  1479    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  68.01 
 
 
1137 aa  1636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  89.2 
 
 
1157 aa  2149    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  83.7 
 
 
1012 aa  1783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  99.07 
 
 
951 aa  1312    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  93.87 
 
 
1158 aa  2259    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  79.55 
 
 
837 aa  1370    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  97.62 
 
 
522 aa  1036    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  85.3 
 
 
1159 aa  2040    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  85.38 
 
 
1159 aa  2044    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  100 
 
 
1157 aa  2391    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  93.87 
 
 
1158 aa  2259    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  68.33 
 
 
1132 aa  1648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  82.52 
 
 
881 aa  1528    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  34.06 
 
 
1059 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  34.33 
 
 
1051 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  96.31 
 
 
217 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  31.24 
 
 
1100 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  36.08 
 
 
1103 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  30.85 
 
 
1092 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  33.52 
 
 
1133 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  31.11 
 
 
1101 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  29.92 
 
 
1543 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  36.97 
 
 
3238 aa  393  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  36.87 
 
 
3521 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  35.54 
 
 
1221 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  35.36 
 
 
1219 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  29.72 
 
 
1067 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  36.87 
 
 
2899 aa  386  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  36.24 
 
 
2900 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  28.71 
 
 
1061 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  36.19 
 
 
3286 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  35.37 
 
 
3006 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  30.81 
 
 
1816 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  34.85 
 
 
2140 aa  366  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  30.54 
 
 
1341 aa  365  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  32.63 
 
 
1188 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  30.7 
 
 
1194 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  29.99 
 
 
2007 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  32.31 
 
 
1057 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  27.03 
 
 
960 aa  175  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  26.64 
 
 
1644 aa  98.6  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  41.41 
 
 
1093 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  41.41 
 
 
1093 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.54 
 
 
1830 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.01 
 
 
918 aa  56.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  29.67 
 
 
2400 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  24.14 
 
 
779 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  23.16 
 
 
782 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  25.87 
 
 
934 aa  50.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  32.35 
 
 
1915 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>