192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1242 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  51.66 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  44.27 
 
 
192 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  43.62 
 
 
257 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  42.56 
 
 
214 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  42.78 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  42.55 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  41.41 
 
 
201 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  38.97 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  37.44 
 
 
213 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  38.17 
 
 
239 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.7 
 
 
211 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.04 
 
 
204 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  40.41 
 
 
213 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  42.33 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  38.34 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  39.9 
 
 
198 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.89 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  39.79 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  39.7 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  38.38 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  38.92 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.65 
 
 
241 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  34.87 
 
 
195 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  38.74 
 
 
251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.65 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  40 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.6 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  38.31 
 
 
252 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  40.74 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  36.13 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  40.21 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  38.31 
 
 
233 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  37.19 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  39.68 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  37.89 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  37.1 
 
 
223 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  36.84 
 
 
210 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  37.89 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  36.68 
 
 
208 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.97 
 
 
237 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.07 
 
 
228 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  33.16 
 
 
219 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  38.69 
 
 
212 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  34.04 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  31.77 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.22 
 
 
227 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  31.89 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  33.68 
 
 
200 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  31.84 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  32.32 
 
 
266 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  32.8 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.52 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  32.8 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  32.12 
 
 
249 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  35.71 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  32.37 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  30.89 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  32.95 
 
 
215 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  32.28 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  29.63 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  30.86 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  30.69 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  30.89 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  31.76 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  30.69 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  32.28 
 
 
201 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  31.75 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  31.79 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  29.53 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  29.47 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  31.75 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  27.89 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  29.5 
 
 
255 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  34.18 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  29.02 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  30.21 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  31.69 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  29.63 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  30.57 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  29.73 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  30.57 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  30.57 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  30.57 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  31.02 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  31.41 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  30.96 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  30.65 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.38 
 
 
270 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  31.28 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.91 
 
 
270 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  30.11 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  30.26 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  27.98 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  30.16 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>