More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2889 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  799    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  78.01 
 
 		 393 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  73.72 
 
 		 461 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  66.67 
 
 		 398 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  64.19 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  60.36 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  51.93 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  51.29 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  56.14 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  48.06 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 396 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  48.06 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  46.34 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 398 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 393 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  44.1 
 
 		 397 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  41.24 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 		 398 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 		 393 aa  275  7e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 		 393 aa  268  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  37.77 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 		 394 aa  254  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  34.02 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.21 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  35.57 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.83 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  30.65 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  34.71 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.44 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  30.03 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.31 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.22 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.34 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.47 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  32.6 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.79 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.22 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.43 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.56 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.37 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  34.48 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.8 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  29.36 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.93 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.37 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  31.18 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.14 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  31.45 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  32.19 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.79 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  33.24 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.87 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  36.64 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.89 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.84 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.13 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.5 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  28.42 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  29.28 
 
 		 388 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>