More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1281 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
105 aa  206  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  59.22 
 
 
104 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
103 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.98 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  54.46 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  105  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
101 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.19 
 
 
223 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
146 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
104 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
102 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
104 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
115 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
132 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
104 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
103 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
104 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  100  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
115 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
104 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 
149 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
101 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>