More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2847 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  590  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  85.67 
 
 
307 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  79.67 
 
 
330 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  72.04 
 
 
307 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  71.29 
 
 
306 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  71.62 
 
 
306 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  69.97 
 
 
306 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  67.31 
 
 
310 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  59.87 
 
 
307 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  60.73 
 
 
307 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  63.61 
 
 
305 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  59.74 
 
 
308 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  58.88 
 
 
307 aa  335  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  58.63 
 
 
307 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  64.69 
 
 
307 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  61.2 
 
 
316 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  60.87 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  60.93 
 
 
306 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  55.15 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  51.15 
 
 
308 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  53.31 
 
 
304 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  50.66 
 
 
308 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  54.64 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  50.82 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  51.16 
 
 
320 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  49.84 
 
 
307 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  49.01 
 
 
343 aa  275  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  53.72 
 
 
312 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  46.86 
 
 
305 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  50 
 
 
307 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  51.8 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  46.94 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  51.16 
 
 
307 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  51.82 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  51.48 
 
 
301 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  39.44 
 
 
342 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  34.78 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.64 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  33.93 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  34.56 
 
 
352 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.31 
 
 
350 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  32.99 
 
 
346 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.63 
 
 
356 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  31.92 
 
 
349 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  29.93 
 
 
427 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  31.13 
 
 
345 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 
346 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  30.48 
 
 
426 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.15 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  31.29 
 
 
443 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
415 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 
420 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  37.85 
 
 
362 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  30.17 
 
 
428 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.01 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
415 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  29.87 
 
 
417 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.89 
 
 
300 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  34.83 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  28.12 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.52 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.2 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  30.85 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  27.76 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  28.04 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  28.27 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  30.04 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  28.27 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.74 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  26.52 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.18 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  22.74 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  27.14 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  31.64 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  27.14 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.74 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  26.15 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  28.15 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  26.25 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  25.87 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  27.21 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  23.51 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  31.46 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  25.56 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
255 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.12 
 
 
2798 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.75 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  29.81 
 
 
255 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>