More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0175 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
601 aa  1159    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.82 
 
 
612 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  42.68 
 
 
574 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  39.89 
 
 
566 aa  347  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.92 
 
 
568 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
595 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.15 
 
 
577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.64 
 
 
569 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.64 
 
 
569 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  39.4 
 
 
564 aa  331  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41 
 
 
571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  39.4 
 
 
581 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.49 
 
 
563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  41.37 
 
 
579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 
572 aa  320  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.38 
 
 
560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.01 
 
 
565 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.1 
 
 
778 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  39.02 
 
 
551 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.83 
 
 
572 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  37.65 
 
 
567 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  37.3 
 
 
567 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.13 
 
 
567 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.84 
 
 
537 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.97 
 
 
560 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  36.82 
 
 
620 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.8 
 
 
567 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  38.18 
 
 
579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.93 
 
 
594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  38.51 
 
 
559 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.3 
 
 
800 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.56 
 
 
631 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.59 
 
 
604 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  38.58 
 
 
559 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.9 
 
 
623 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.11 
 
 
593 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  30.93 
 
 
593 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  29.1 
 
 
606 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.16 
 
 
623 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.63 
 
 
600 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.22 
 
 
837 aa  257  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  32.11 
 
 
663 aa  256  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.89 
 
 
600 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.72 
 
 
629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.22 
 
 
258 aa  252  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  40.11 
 
 
561 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.26 
 
 
481 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.96 
 
 
867 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.5 
 
 
611 aa  230  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  35.45 
 
 
655 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.05 
 
 
547 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.99 
 
 
574 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.72 
 
 
257 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.6 
 
 
577 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.8 
 
 
259 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.9 
 
 
958 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.27 
 
 
469 aa  203  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  44.83 
 
 
329 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  44.83 
 
 
329 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  44.02 
 
 
331 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  44.02 
 
 
458 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  43.75 
 
 
326 aa  188  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.92 
 
 
329 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
472 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.18 
 
 
240 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.86 
 
 
328 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  42.41 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.41 
 
 
253 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.31 
 
 
495 aa  185  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  39.64 
 
 
495 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.37 
 
 
240 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  43.08 
 
 
255 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.24 
 
 
241 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  39.64 
 
 
495 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.13 
 
 
451 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  39.64 
 
 
495 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.57 
 
 
261 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.48 
 
 
244 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.66 
 
 
777 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.7 
 
 
253 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.84 
 
 
241 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.31 
 
 
772 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.84 
 
 
241 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.84 
 
 
241 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.58 
 
 
263 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 
241 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  40 
 
 
241 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  44.79 
 
 
287 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.71 
 
 
242 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  46.06 
 
 
526 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.31 
 
 
776 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.77 
 
 
327 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  44.09 
 
 
258 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.37 
 
 
236 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.46 
 
 
253 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.1 
 
 
254 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
253 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 
243 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.05 
 
 
797 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.14 
 
 
254 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>