More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1907 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 310 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  56.35 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2066  thioredoxin reductase (NADPH)  56.16 
 
 		 292 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  54.72 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  50.87 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  44.74 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  44.04 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.51 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.41 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 304 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 396 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  43.71 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.17 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  42.43 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  39.54 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  39.41 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  38.91 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.48 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  40.39 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  39.54 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.03 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  40.86 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.35 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.35 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.2 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  38.31 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  40.4 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  40.92 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  41.58 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  41.86 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  36.88 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  40.34 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  39.07 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  37.7 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.08 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.25 
 
 		 409 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  36.27 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  39.47 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  37.46 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  40 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.74 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  39.03 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  39.43 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  39.43 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  40.6 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  39.13 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  36.48 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  35.71 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  39.44 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  40.25 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  34.85 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  36.01 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  39.26 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  35.16 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  38.89 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>