136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1277 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  100 
 
 
438 aa  847    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.82 
 
 
539 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.1 
 
 
435 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  45.33 
 
 
452 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 
438 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.68 
 
 
436 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  24.43 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27.13 
 
 
480 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.01 
 
 
519 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
538 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.42 
 
 
357 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
357 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
357 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.42 
 
 
357 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.02 
 
 
357 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.42 
 
 
357 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
357 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.42 
 
 
357 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.89 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.1 
 
 
290 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.02 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.65 
 
 
588 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  20.98 
 
 
277 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.39 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.19 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  26.16 
 
 
466 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.54 
 
 
257 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.68 
 
 
247 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  26.74 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  29.73 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.55 
 
 
228 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  37.5 
 
 
327 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.03 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  28.49 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  28.4 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  29.19 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  28.7 
 
 
918 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.93 
 
 
368 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  27.33 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  27.33 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.43 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
331 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  32.1 
 
 
261 aa  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  26.47 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  26.8 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.78 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.32 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  26.47 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.23 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  27.22 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.12 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.69 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  30.11 
 
 
276 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  25.6 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  30.88 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.08 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  27.47 
 
 
272 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  24.42 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.29 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  36.17 
 
 
109 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
285 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 
288 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  26.32 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  27.81 
 
 
438 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.84 
 
 
240 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  24.42 
 
 
468 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
272 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  25.27 
 
 
474 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.47 
 
 
232 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1964  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  30.63 
 
 
766 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  25 
 
 
465 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  35.44 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.86 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  25.73 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.11 
 
 
238 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.23 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  25.73 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  39.34 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.75 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.92 
 
 
233 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.18 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  33.78 
 
 
579 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  23.84 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  25.73 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  31.48 
 
 
110 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.16 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.72 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.91 
 
 
228 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  27.22 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>