More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1613 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  78.17 
 
 		 164 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  69.44 
 
 		 187 aa  214  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  69.85 
 
 		 165 aa  205  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  65.25 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  68.38 
 
 		 198 aa  197  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  62.86 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  62.14 
 
 		 154 aa  186  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  60.71 
 
 		 164 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  66.2 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  60.14 
 
 		 172 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  59.85 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  56.64 
 
 		 202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  58.45 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 152 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  58.27 
 
 		 202 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  59.44 
 
 		 178 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  58.74 
 
 		 178 aa  177  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  58.74 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  58.99 
 
 		 173 aa  176  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  60.43 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 184 aa  175  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  58.27 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  58.27 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  59.29 
 
 		 177 aa  175  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 179 aa  174  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 177 aa  174  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  58.04 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  58.65 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 171 aa  174  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 		 198 aa  174  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  56.64 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 		 174 aa  173  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  56.83 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  58.27 
 
 		 222 aa  173  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 357 aa  173  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  57.66 
 
 		 181 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  58.52 
 
 		 204 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  55 
 
 		 238 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  57.25 
 
 		 207 aa  172  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  57.45 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  56.43 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  54.55 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  57.55 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  55.17 
 
 		 243 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  57.25 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  54.68 
 
 		 212 aa  170  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  59.26 
 
 		 227 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  55.86 
 
 		 250 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  58.45 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.29 
 
 		 173 aa  168  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 190 aa  168  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  57.45 
 
 		 225 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  56.52 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 186 aa  166  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  56.43 
 
 		 168 aa  166  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  59.26 
 
 		 169 aa  166  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 219 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  56.03 
 
 		 179 aa  165  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  55.07 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  54.68 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  54.29 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  52.45 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  57.35 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  52.86 
 
 		 176 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>