More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0174 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  84.08 
 
 		 158 aa  266  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  78.85 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  67.72 
 
 		 160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  63.87 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  69.28 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  58.44 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  60.53 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 175 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  57.25 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  53.47 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  47.55 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  45.51 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.02 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  48.67 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  46.71 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  45.39 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  44.37 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  40.67 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>