More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1982 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  51.14 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  50.67 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  46.02 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  49.09 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  46.02 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  46.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.05 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.01 
 
 		 511 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.01 
 
 		 511 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.7 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1211  cytidylate kinase  45 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00218748  normal  0.15361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>